O pré-vestibular do Núcleo Villa-Lobos teve início em 2004 com o intuito de preparar os alunos para as provas de Música da UFMG, UEMG e, mais tarde, da UFOP e UFSJ. O vestibular de Música (Licenciatura, Bacharelado, Composição e Regência) consta de duas etapas: a primeira com provas de Português, Matemática, História e outras disciplinas do ensino médio, assim como nos demais cursos. A segunda etapa consiste em avaliações específicas que requerem do candidato conhecimentos de ordem teórica e prática, sempre focando sua vivência auditiva. É para essa fase que o pré-vestibular do Núcleo Villa-Lobos, com sua metodologia de ensino e experiência, capacita seus alunos e consegue um alto índice de aprovação. Sua metodologia consiste em treinamentos rítmico e melódico e destaca tanto a música folclórica e as canções da MPB, quanto peças do repertório europeu. A escuta musical é direcionada para diferentes estilos. Integram o material didático, solfejos com sonoridades dos sistemas pentatônico, modal e tonal. O curso possui duração de um ano e consta de aulas semanais de teoria e percepção musical e de instrumento.